Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms