Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms