Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS25P82663 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS25P82663 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms