Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC5P78333 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC5P78333 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC5P78333 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC5P78333 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC5P78333 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC5P78333 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC5P78333 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC5P78333 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms