Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P62891 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P62891 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P62891 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P62891 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms