Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VSNL1P62760 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSNL1P62760 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms