Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF3P61204 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF3P61204 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF3P61204 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF3P61204 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF3P61204 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF3P61204 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF3P61204 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF3P61204 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARF3P61204 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARF3P61204 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF3P61204 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF3P61204 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF3P61204 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARF3P61204 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARF3P61204 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF3P61204 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF3P61204 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF3P61204 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF3P61204 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARF3P61204 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms