Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB2AP61019 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB2AP61019 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms