Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP4P57796 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP4P57796 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP4P57796 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP4P57796 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP4P57796 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP4P57796 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP4P57796 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP4P57796 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP4P57796 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP4P57796 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP4P57796 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP4P57796 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP4P57796 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP4P57796 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP4P57796 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP4P57796 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP4P57796 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP4P57796 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP4P57796 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP4P57796 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP4P57796 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP4P57796 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP4P57796 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP4P57796 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP4P57796 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP4P57796 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP4P57796 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP4P57796 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CABP4P57796 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CABP4P57796 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CABP4P57796 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms