Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms