Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EDDM3BP56851 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDDM3BP56851 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms