Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH8P55286 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH8P55286 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH8P55286 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH8P55286 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH8P55286 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH8P55286 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH8P55286 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH8P55286 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH8P55286 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH8P55286 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH8P55286 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH8P55286 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH8P55286 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH8P55286 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH8P55286 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH8P55286 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH8P55286 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH8P55286 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH8P55286 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH8P55286 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH8P55286 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms