Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLTPP55058 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLTPP55058 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLTPP55058 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLTPP55058 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLTPP55058 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLTPP55058 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms