Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms