Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP98P52948 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP98P52948 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP98P52948 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP98P52948 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP98P52948 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP98P52948 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP98P52948 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP98P52948 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP98P52948 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP98P52948 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP98P52948 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP98P52948 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP98P52948 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP98P52948 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP98P52948 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP98P52948 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP98P52948 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUP98P52948 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP98P52948 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP98P52948 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP98P52948 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP98P52948 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP98P52948 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP98P52948 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP98P52948 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUP98P52948 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUP98P52948 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUP98P52948 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms