Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THOP1P52888 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THOP1P52888 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THOP1P52888 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
THOP1P52888 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THOP1P52888 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THOP1P52888 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms