Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF138P52744 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms