Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTDSS1P48651 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTDSS1P48651 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTDSS1P48651 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTDSS1P48651 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTDSS1P48651 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms