Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A3P47895 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms