Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRXP46100 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRXP46100 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRXP46100 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRXP46100 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRXP46100 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATRXP46100 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRXP46100 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRXP46100 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRXP46100 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATRXP46100 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms