Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDH1P40925 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDH1P40925 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDH1P40925 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MDH1P40925 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MDH1P40925 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms