Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TGFBR1P36897 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms