Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT2P35908 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT2P35908 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT2P35908 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT2P35908 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT2P35908 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT2P35908 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT2P35908 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT2P35908 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms