Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBL1P28749 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBL1P28749 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBL1P28749 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBL1P28749 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBL1P28749 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBL1P28749 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBL1P28749 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBL1P28749 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBL1P28749 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBL1P28749 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBL1P28749 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBL1P28749 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBL1P28749 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBL1P28749 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBL1P28749 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBL1P28749 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RBL1P28749 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBL1P28749 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBL1P28749 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBL1P28749 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms