Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLDCP23378 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLDCP23378 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLDCP23378 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLDCP23378 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLDCP23378 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLDCP23378 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLDCP23378 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GLDCP23378 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLDCP23378 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLDCP23378 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLDCP23378 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLDCP23378 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLDCP23378 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLDCP23378 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLDCP23378 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLDCP23378 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLDCP23378 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLDCP23378 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLDCP23378 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLDCP23378 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLDCP23378 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLDCP23378 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms