Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX1P22670 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX1P22670 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX1P22670 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RFX1P22670 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX1P22670 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX1P22670 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX1P22670 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX1P22670 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX1P22670 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX1P22670 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms