Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BPBP20851 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms