Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAB4AP20338 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms