Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms