Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFKB1P19838 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms