Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMD1P17707 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMD1P17707 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMD1P17707 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMD1P17707 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMD1P17707 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMD1P17707 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMD1P17707 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMD1P17707 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMD1P17707 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMD1P17707 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMD1P17707 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMD1P17707 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMD1P17707 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMD1P17707 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms