Protein–RNA interactions for Protein: P0C7X2

ZNF688, Zinc finger protein 688, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF688P0C7X2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF688P0C7X2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF688P0C7X2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms