Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TNP1P09430 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TNP1P09430 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TNP1P09430 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
TNP1P09430 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
TNP1P09430 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms