Protein–RNA interactions for Protein: P01584

IL1B, Interleukin-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1BP01584 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL1BP01584 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL1BP01584 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IL1BP01584 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IL1BP01584 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IL1BP01584 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL1BP01584 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL1BP01584 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL1BP01584 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL1BP01584 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL1BP01584 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL1BP01584 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL1BP01584 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IL1BP01584 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1BP01584 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1BP01584 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1BP01584 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1BP01584 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1BP01584 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1BP01584 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL1BP01584 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL1BP01584 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL1BP01584 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms