Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFNA21P01568 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms