Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RAPGEF3O95398 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms