Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRMUO75648 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRMUO75648 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRMUO75648 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRMUO75648 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMUO75648 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMUO75648 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMUO75648 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMUO75648 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMUO75648 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMUO75648 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMUO75648 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMUO75648 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMUO75648 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMUO75648 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms