Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PITX3O75364 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PITX3O75364 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX3O75364 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX3O75364 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX3O75364 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PITX3O75364 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX3O75364 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms