Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ABCC9O60706 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC44.25■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC44.19■■■■■ 4.67
ABCC9O60706 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
ABCC9O60706 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCC9O60706 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms