Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA5O60264 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCA5O60264 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCA5O60264 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms