Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GATCO43716 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GATCO43716 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GATCO43716 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GATCO43716 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GATCO43716 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GATCO43716 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms