Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN3O15551 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms