Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC4O15439 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC4O15439 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms