Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B4E1Z4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B4E1Z4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
B4E1Z4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E1Z4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E1Z4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B4E1Z4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B4E1Z4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B4E1Z4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B4E1Z4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B4E1Z4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
B4E1Z4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms