Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYSRT1A8MQ03 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYSRT1A8MQ03 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms