Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms