Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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