Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 CLCC1-207ENST00000369976 2468 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 RBM3-201ENST00000354480 1884 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 GNGT2-204ENST00000511277 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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SCN2BO60939 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SCN2BO60939 METTL4-203ENST00000574538 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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