Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX5Q9Y5X3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX5Q9Y5X3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms