Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms